42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47585 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47585  predicted protein  100 
 
 
271 aa  546  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  27.31 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  25.78 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  30.97 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  30.17 
 
 
207 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  28 
 
 
245 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  28.51 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  25.31 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  28 
 
 
422 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  29.65 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  27.19 
 
 
228 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  26.7 
 
 
204 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  26.6 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  27.8 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  26.29 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  25.53 
 
 
207 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  28.51 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  25.22 
 
 
568 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  29.96 
 
 
218 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  25.79 
 
 
241 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  25.37 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  25.54 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  25.56 
 
 
194 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  24.9 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  26.34 
 
 
205 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  24.76 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  24.23 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  24.23 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  32.46 
 
 
222 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  24.68 
 
 
192 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  28.96 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  26.34 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 
458 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  27.27 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  25.11 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  22.91 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  23.81 
 
 
221 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  25.78 
 
 
197 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  28.19 
 
 
210 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  30.73 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>