16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46378 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46378  predicted protein  100 
 
 
509 aa  1056    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49209  predicted protein  40 
 
 
526 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0370698  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  43.71 
 
 
467 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  38.94 
 
 
1110 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  35.12 
 
 
1245 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  41.57 
 
 
1245 aa  157  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  40.22 
 
 
1009 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1270  hypothetical protein  30.27 
 
 
307 aa  94.4  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16390  hypothetical protein  28.44 
 
 
188 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.244545 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44593  predicted protein  30.46 
 
 
518 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3543  hypothetical protein  23.59 
 
 
298 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.165019  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43213  predicted protein  27.78 
 
 
819 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2008  putative lipoprotein  23.61 
 
 
267 aa  51.6  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1454  hypothetical protein  25.71 
 
 
322 aa  47  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0623  hypothetical protein  23.48 
 
 
236 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000131012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1627  hypothetical protein  26.64 
 
 
406 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495644  normal  0.858614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>