35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44426 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44426  predicted protein  100 
 
 
638 aa  1296    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09095  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 4 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARI5]  40.43 
 
 
461 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3507  predicted protein  38.8 
 
 
330 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.22649 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04870  conserved hypothetical protein  38.79 
 
 
504 aa  229  8e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.393554  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02320  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 
491 aa  57.4  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  30.95 
 
 
571 aa  55.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  24.63 
 
 
533 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00680  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 
155 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.310644  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08061  Peptidyl-prolyl isomerase cwc27 (EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUG9]  31.29 
 
 
558 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.146948  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  31.58 
 
 
629 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06894  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 2 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8)(Cyclophilin-60)(Cyclophilin-like protein Cyp-60) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXT6]  23.53 
 
 
580 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.242482 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  36 
 
 
76 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  26.29 
 
 
174 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0545  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.54 
 
 
252 aa  48.9  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
125 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
373 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06903  U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa (AFU_orthologue; AFUA_5G13480)  26.83 
 
 
373 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1198  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  28.69 
 
 
657 aa  47.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  25.48 
 
 
2604 aa  47.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  32 
 
 
455 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  28.57 
 
 
184 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.46 
 
 
195 aa  46.2  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 
573 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  35.82 
 
 
160 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.85 
 
 
466 aa  45.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.6 
 
 
468 aa  45.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0632  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.66 
 
 
250 aa  45.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  27.91 
 
 
284 aa  45.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.121844 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  28.35 
 
 
178 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01841  hypothetical protein  27.14 
 
 
164 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  30.86 
 
 
687 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  30 
 
 
552 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003838  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase PpiB  27.14 
 
 
164 aa  43.9  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000299744  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  31.58 
 
 
246 aa  43.9  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0209  peptidylprolyl isomerase  25.81 
 
 
169 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0725902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>