More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42857 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42857  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
888 aa  1837    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  50.45 
 
 
251 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  50.91 
 
 
247 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
249 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 
249 aa  234  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  50 
 
 
246 aa  233  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  233  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
250 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
250 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  49.09 
 
 
250 aa  231  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
270 aa  230  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
270 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
270 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
250 aa  230  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
248 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
247 aa  229  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 
248 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 
270 aa  227  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
248 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.96 
 
 
248 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
250 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
250 aa  226  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 
250 aa  226  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
248 aa  226  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
248 aa  225  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  47.21 
 
 
247 aa  225  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
249 aa  224  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
249 aa  224  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
249 aa  224  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
249 aa  224  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
251 aa  224  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
249 aa  224  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
249 aa  224  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
250 aa  224  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
249 aa  224  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  49.09 
 
 
249 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
247 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
250 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
250 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  46.85 
 
 
306 aa  222  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
250 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
250 aa  222  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
248 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 
247 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
232 aa  221  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
247 aa  221  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  46.82 
 
 
247 aa  219  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  46.36 
 
 
247 aa  219  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 
247 aa  220  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  45 
 
 
248 aa  220  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
245 aa  219  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.91 
 
 
247 aa  219  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
245 aa  219  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.45 
 
 
250 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
245 aa  218  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  47.73 
 
 
247 aa  218  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 
249 aa  218  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
245 aa  218  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
245 aa  218  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  46.82 
 
 
245 aa  218  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  47.27 
 
 
247 aa  217  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  47.27 
 
 
234 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  46.36 
 
 
245 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  46.36 
 
 
245 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
229 aa  217  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  45.91 
 
 
247 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  45 
 
 
248 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 
240 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  45.45 
 
 
245 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  45.91 
 
 
247 aa  214  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
229 aa  214  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  45.45 
 
 
234 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  46.36 
 
 
245 aa  214  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  46.36 
 
 
253 aa  213  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 
227 aa  213  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
251 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  45.29 
 
 
230 aa  213  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43253  predicted protein  43.57 
 
 
539 aa  212  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
251 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  44.54 
 
 
247 aa  212  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 
248 aa  212  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
245 aa  211  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  44.09 
 
 
248 aa  211  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  45.45 
 
 
229 aa  211  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  46.67 
 
 
237 aa  211  7e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 
237 aa  210  8e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  48.67 
 
 
249 aa  210  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  48.85 
 
 
230 aa  210  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  47.51 
 
 
333 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>