25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42836 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42836  predicted protein  100 
 
 
347 aa  711    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08430  Kelch repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12780)  30.47 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23798  predicted protein  26.33 
 
 
710 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  26.35 
 
 
639 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  28.97 
 
 
577 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545063 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02090  Kelch repeats protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04970)  30.59 
 
 
677 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  31.36 
 
 
536 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  31.36 
 
 
536 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  24.76 
 
 
924 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  26.94 
 
 
494 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  24.64 
 
 
970 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  26.34 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  26.49 
 
 
1556 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  26.87 
 
 
506 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00813  conserved kelch repeat protein TeaB (Eurofung)  29.17 
 
 
713 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03800  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  29.61 
 
 
465 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  26.09 
 
 
586 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42978  predicted protein  29.46 
 
 
632 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_2897  predicted protein  28.65 
 
 
317 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000438685  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  30.53 
 
 
1474 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  23.6 
 
 
990 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.44 
 
 
471 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  23.04 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  27.08 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94478  predicted protein  35.58 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0486336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>