29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt42 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt42  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0009  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0007  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0006  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873088  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07679  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.342571  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0043  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0044  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07677  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204816  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0055  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000011398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0600  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA22  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0597  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLys02  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLys01  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0014  tRNA-Val  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.328994 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0006  tRNA-Lys  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303657  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0012  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>