29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tLys01 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_tLys01  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLys02  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0025  tRNA-Lys  92 
 
 
76 bp  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022777  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0024  tRNA-Lys  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0005  tRNA-Lys  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0003  tRNA-Lys  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.685555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0017  tRNA-Lys  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.253247  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0066  tRNA-Lys  89.33 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0068  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437414  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0067  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0081  tRNA-Lys  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0078  tRNA-Lys  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000025771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0010  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354974  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0043  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0044  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0009  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0007  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0006  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0006  tRNA-Lys  87.93 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0019  tRNA-Lys  85.29 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt42  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  84.48 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt34  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>