17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1096 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  752    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  34.88 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  35.94 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  33 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  32.78 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  35.4 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  32.7 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  32.53 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  23.43 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  32.98 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  25 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  25.08 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  32.14 
 
 		 353 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  24.75 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  37.04 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  24.19 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  23.33 
 
 		 587 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>