62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2675 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  59.57 
 
 
580 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
572 aa  1172    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  60.29 
 
 
563 aa  703    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  98.08 
 
 
572 aa  1150    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  47.51 
 
 
560 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  49.02 
 
 
571 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  45.96 
 
 
539 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  47.18 
 
 
568 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  43.94 
 
 
568 aa  458  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 
525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  45.88 
 
 
587 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  44.4 
 
 
578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  45.22 
 
 
581 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  43.3 
 
 
621 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  41.17 
 
 
601 aa  412  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  38.72 
 
 
552 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  41.07 
 
 
598 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 
625 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 
625 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.43 
 
 
625 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 
623 aa  316  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 
533 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  35.44 
 
 
580 aa  300  6e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 
563 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  35.35 
 
 
577 aa  294  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  34.63 
 
 
563 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
563 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
563 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 
565 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.86 
 
 
584 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  35.01 
 
 
559 aa  273  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.297776 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 
594 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  32.84 
 
 
601 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
574 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.44 
 
 
559 aa  261  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
559 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  31.56 
 
 
576 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  31.73 
 
 
600 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 
537 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  32.15 
 
 
537 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  32.15 
 
 
537 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  32.15 
 
 
537 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  26.84 
 
 
626 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  25.2 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  24.41 
 
 
530 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
506 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
541 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 
871 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  26.04 
 
 
556 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
532 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2168  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 
537 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.58 
 
 
1023 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 
878 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
284 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.3 
 
 
810 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
3172 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 
268 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  37.68 
 
 
864 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1082 aa  44.3  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0808  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
486 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224492  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.06 
 
 
293 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  38.03 
 
 
734 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>