21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4738 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3946  glycosyl transferase family 39  42.04 
 
 		 823 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566325  normal  0.0142846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4821  glycosyl transferase family 39  45.74 
 
 		 820 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0456074  normal  0.800958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4738  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 830 aa  1672    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3937  glycosyl transferase family protein  49.78 
 
 		 897 aa  858    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0634036  hitchhiker  0.000739311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3896  glycosyl transferase family 39  41.92 
 
 		 823 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1296  hypothetical protein  33.83 
 
 		 811 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198169  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1202  hypothetical protein  32.93 
 
 		 822 aa  360  6e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.15338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0327  hypothetical protein  30.53 
 
 		 681 aa  194  8e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2363  hypothetical protein  31.31 
 
 		 688 aa  185  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07141  hypothetical protein  25.7 
 
 		 698 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.340212  normal  0.245946 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08111  glycosyltransferase  28.51 
 
 		 704 aa  172  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296604 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0090  hypothetical protein  25.99 
 
 		 698 aa  169  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26291  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.31 
 
 		 697 aa  167  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 311 aa  48.5  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 942 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 547 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 363 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 363 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 1198 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  26.11 
 
 		 618 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  46 
 
 		 594 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>