18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3937 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3946  glycosyl transferase family 39  40.36 
 
 		 823 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566325  normal  0.0142846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4821  glycosyl transferase family 39  40.77 
 
 		 820 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0456074  normal  0.800958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3937  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 897 aa  1818    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0634036  hitchhiker  0.000739311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4738  glycosyl transferase family 39  49.94 
 
 		 830 aa  844    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3896  glycosyl transferase family 39  40.47 
 
 		 823 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1296  hypothetical protein  33.44 
 
 		 811 aa  361  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198169  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1202  hypothetical protein  28.82 
 
 		 822 aa  243  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.15338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08111  glycosyltransferase  28.7 
 
 		 704 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296604 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07141  hypothetical protein  25.5 
 
 		 698 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.340212  normal  0.245946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0327  hypothetical protein  26.14 
 
 		 681 aa  166  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0090  hypothetical protein  25.38 
 
 		 698 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2363  hypothetical protein  27.37 
 
 		 688 aa  159  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26291  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.21 
 
 		 697 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.1 
 
 		 1838 aa  47.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.16 
 
 		 547 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 4079 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2236  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  28.47 
 
 		 586 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  29.57 
 
 		 1237 aa  44.3  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>