28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4394 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4394  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  393  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0617  DNA uptake protein related DNA-binding protein  58.43 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0602  hypothetical protein  58.43 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1225  hypothetical protein  55.88 
 
 		 176 aa  194  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0930  hypothetical protein  55.29 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4560  hypothetical protein  55.49 
 
 		 167 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0869  hypothetical protein  42.41 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000493602  normal  0.0426802 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2106  hypothetical protein  33.58 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0563  hypothetical protein  27.01 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3848  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.91 
 
 		 279 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30.67 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42 
 
 		 296 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1931  hypothetical protein  31.97 
 
 		 295 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0313  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.18 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0283813  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  27.2 
 
 		 252 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  27.2 
 
 		 252 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  42 
 
 		 224 aa  44.7  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3469  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.64 
 
 		 280 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1287  DNA uptake protein and related DNA-binding protein  24.63 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  25.37 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1233  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.47 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  22.76 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1371  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30.51 
 
 		 253 aa  42  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.106301  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0664  hypothetical protein  24.14 
 
 		 237 aa  41.6  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  35.29 
 
 		 243 aa  41.2  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  20.87 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2803  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30.36 
 
 		 277 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>