19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0930 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0930  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1225  hypothetical protein  75.71 
 
 
176 aa  275  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4394  hypothetical protein  55.29 
 
 
193 aa  193  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4560  hypothetical protein  57.32 
 
 
167 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0617  DNA uptake protein related DNA-binding protein  49.71 
 
 
179 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0602  hypothetical protein  49.71 
 
 
179 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0869  hypothetical protein  42.04 
 
 
196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000493602  normal  0.0426802 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0563  hypothetical protein  29.41 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2106  hypothetical protein  31.62 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  32 
 
 
252 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  32 
 
 
252 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  29.03 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  29.03 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1233  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  27.45 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1287  DNA uptake protein and related DNA-binding protein  29.03 
 
 
306 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1741  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  28.57 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  25.18 
 
 
227 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0835  hypothetical protein  23.19 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1466  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.07 
 
 
769 aa  41.2  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>