15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1463 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1463  protein of unknown function DUF955  100 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  26.96 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2753  hypothetical protein  49.06 
 
 
80 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221804  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  32.24 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  32.24 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  26.88 
 
 
156 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  31.37 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  30 
 
 
376 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.28 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1262  hypothetical protein  29.52 
 
 
255 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.228551  normal  0.373581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  26.11 
 
 
266 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  33.61 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  25.79 
 
 
173 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  25.3 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  29.57 
 
 
289 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>