16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0568 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0568  hypothetical protein  100 
 
 
627 aa  1263    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1620  hypothetical protein  27.61 
 
 
585 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1563  hypothetical protein  27.61 
 
 
585 aa  179  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0641999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6539  hypothetical protein  25.48 
 
 
571 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.360939  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0938  hypothetical protein  27.53 
 
 
463 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2808  hypothetical protein  27.76 
 
 
474 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711174  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2217  hypothetical protein  26.65 
 
 
439 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3514  hypothetical protein  27.69 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.666234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0765  hypothetical protein  27.85 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0474  hypothetical protein  25.13 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.153651  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3464  hypothetical protein  26.51 
 
 
437 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38137  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2305  hypothetical protein  27.2 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2947  hypothetical protein  26.17 
 
 
437 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  0.624545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2473  hypothetical protein  25.91 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852078  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2060  hypothetical protein  26.3 
 
 
435 aa  64.7  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522944  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  28.89 
 
 
464 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>