31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72920 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72920  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  256  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6328  hypothetical protein  99.25 
 
 
133 aa  256  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5518  hypothetical protein  74.81 
 
 
135 aa  196  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5067  hypothetical protein  74.07 
 
 
135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5403  hypothetical protein  77.04 
 
 
135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5647  hypothetical protein  73.33 
 
 
135 aa  194  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0156026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5132  hypothetical protein  73.53 
 
 
135 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.161261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4522  hypothetical protein  73.33 
 
 
135 aa  192  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5354  hypothetical protein  72.59 
 
 
135 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206847  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00400  hypothetical protein  71.85 
 
 
135 aa  191  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5262  hypothetical protein  73.33 
 
 
135 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2616  hypothetical protein  55.64 
 
 
133 aa  165  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.942508  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0840  hypothetical protein  57.58 
 
 
133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00324718  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2971  hypothetical protein  55.73 
 
 
133 aa  164  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000061092  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0757  hypothetical protein  54.14 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299763  normal  0.176854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3181  hypothetical protein  54.14 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.685781  normal  0.0661011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0683  hypothetical protein  52.27 
 
 
135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00839413  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3559  hypothetical protein  52.27 
 
 
135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0452372  normal  0.150026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3627  hypothetical protein  52.27 
 
 
135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0789  hypothetical protein  52.63 
 
 
135 aa  160  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3750  hypothetical protein  52.27 
 
 
135 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154737  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3847  hypothetical protein  54.14 
 
 
135 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3511  hypothetical protein  51.13 
 
 
133 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142709  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0785  hypothetical protein  53.38 
 
 
135 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486854  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0741  hypothetical protein  51.88 
 
 
133 aa  154  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000832007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0909  hypothetical protein  49.62 
 
 
133 aa  153  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170029  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1553  hypothetical protein  54.14 
 
 
134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3179  hypothetical protein  50.75 
 
 
134 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.244795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3226  hypothetical protein  32.09 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0633516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3275  hypothetical protein  30.37 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.612674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2953  hypothetical protein  32.14 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>