19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_69540 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_69540  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149099  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0114  hypothetical protein  29.82 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1743  hypothetical protein  29.17 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0042  hypothetical protein  32.86 
 
 
299 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2537  hypothetical protein  34.97 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  27.34 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0649  hypothetical protein  32.82 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0510982  normal  0.051482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  32.03 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1213  hypothetical protein  23.08 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  34.35 
 
 
270 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  32.82 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2571  hypothetical protein  26.21 
 
 
261 aa  49.3  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2578  hypothetical protein  26.21 
 
 
261 aa  49.3  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0235149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2564  hypothetical protein  26.21 
 
 
261 aa  49.3  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00349718  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  27.6 
 
 
293 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  27.72 
 
 
464 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3948  hypothetical protein  29.77 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3234  hypothetical protein  27.45 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4268  hypothetical protein  28.38 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>