12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2537 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2537  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69540  hypothetical protein  34.97 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149099  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  31.21 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1213  hypothetical protein  26.62 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0839  hypothetical protein  31.82 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1743  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2630  hypothetical protein  27.61 
 
 		 287 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0042  hypothetical protein  32.35 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  31.75 
 
 		 265 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0114  hypothetical protein  25.71 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0629  hypothetical protein  27.13 
 
 		 264 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3718  hypothetical protein  26.72 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.416803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>