29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  89.95 
 
 
575 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1179    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  50.09 
 
 
586 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  45.28 
 
 
574 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  44.93 
 
 
574 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  44.52 
 
 
541 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  45.28 
 
 
573 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  44.31 
 
 
551 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  44.06 
 
 
552 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  46.4 
 
 
559 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  43.57 
 
 
559 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  43.62 
 
 
550 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  42.48 
 
 
559 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  43.21 
 
 
554 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  41.98 
 
 
528 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  55.03 
 
 
552 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  52.68 
 
 
530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  37.94 
 
 
512 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  36.41 
 
 
499 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  43.29 
 
 
578 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  36.02 
 
 
574 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  32.64 
 
 
548 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  30.11 
 
 
568 aa  220  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  42.34 
 
 
581 aa  218  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  29.93 
 
 
568 aa  216  7e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  40.62 
 
 
510 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  37.5 
 
 
331 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
462 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  35.5 
 
 
569 aa  103  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>