27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48560 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48560  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.947349  normal  0.0199481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.45 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.71 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  30.71 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  29.92 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  29.92 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  29.92 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  29.92 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  29.92 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.53 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.83 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.22 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.22 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.34 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.34 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.12 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.23 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  27.48 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  29.23 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.17 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.72 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  26.09 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.46 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.46 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.46 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>