38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_45060  putative transporter  100 
 
 		 304 aa  553  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3835  putative transporter  93.42 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1593  Urea transporter  44.8 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2774  Urea transporter  44.48 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131823  normal  0.29539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  38.13 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  29.47 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3627  Urea transporter  38.68 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.075407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  29.73 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1567  Urea transporter  41.52 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0796625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  31.31 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3867  Urea transporter  41.64 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  27.78 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  29.73 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  28.86 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  24.73 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  24.73 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  30.3 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  30.3 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  30.3 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  25.9 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4679  Urea transporter  35.34 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3688  Urea transporter  35.34 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  30.69 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  28.72 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  32.86 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  28.85 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  36 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  32.73 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1140  Urea transporter  35.23 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3367  Urea transporter  34.89 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000898038  hitchhiker  0.0000000000000178503 
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  27.48 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5621  Urea transporter  33.94 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1868  transporter, putative  26.37 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.593615  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1794  Urea transporter  39.81 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3629  Urea transporter-like protein  43.14 
 
 		 190 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  27.52 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03500  urea transporter  27.57 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2069  Urea transporter  27.84 
 
 		 281 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000722632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>