12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_36490  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  228  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00849453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3131  hypothetical protein  94.83 
 
 		 116 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2299  hypothetical protein  36.94 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0791934  hitchhiker  0.0000121516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3895  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1394  hypothetical protein  32.5 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  hitchhiker  0.00451485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4115  hypothetical protein  35.23 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3917  hypothetical protein  30.21 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  46.43 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  30.97 
 
 		 284 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2191  hypothetical protein  50.98 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0112954  hitchhiker  0.00262939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 269 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>