26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  89.79 
 
 		 234 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3924  sporulation domain-containing protein  57.08 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06070  hypothetical protein  55.71 
 
 		 144 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0917  hypothetical protein  34.8 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260853  hitchhiker  0.00000167824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4562  hypothetical protein  41.09 
 
 		 142 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00149977  normal  0.65254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0612  hypothetical protein  41.09 
 
 		 142 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.653535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  31.19 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5094  hypothetical protein  40.29 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000148168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4764  hypothetical protein  47.17 
 
 		 141 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000255391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0472  hypothetical protein  49.06 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000830985  normal  0.0146685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1779  hypothetical protein  28.31 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0715873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0439  hypothetical protein  49.06 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000459183  unclonable  0.000000225098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0469  hypothetical protein  44.23 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.101572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4290  sporulation domain-containing protein  26.47 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000142012  hitchhiker  0.00000290664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0704  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000345617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  33.1 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  35.9 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  30.34 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  35.63 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  30.43 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  34.69 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  28.68 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  35.66 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  36.08 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02845  hypothetical protein  34.15 
 
 		 306 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>