48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_16321 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
170 aa  334  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  94.12 
 
 
170 aa  315  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  94.12 
 
 
170 aa  314  3e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  92.94 
 
 
170 aa  313  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  61.96 
 
 
171 aa  207  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  63.1 
 
 
170 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  63.1 
 
 
170 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  56.63 
 
 
172 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  47.44 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  46.15 
 
 
160 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 
171 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  35.84 
 
 
178 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  36.47 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  36.09 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  34.71 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.97 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  34.88 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
187 aa  73.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.05 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30.38 
 
 
173 aa  53.9  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.05 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
448 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  31.85 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  28.66 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.62 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
175 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  29.19 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  25.64 
 
 
165 aa  44.3  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  25.16 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  29.92 
 
 
164 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  29.92 
 
 
164 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  31.88 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  26.63 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  26.04 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  24.53 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  20.92 
 
 
193 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 
175 aa  40.8  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
156 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
156 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>