28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_15461 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_15461  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  221  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  74.29 
 
 
120 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15681  hypothetical protein  69.37 
 
 
111 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15831  hypothetical protein  67.57 
 
 
111 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  31.07 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  33.64 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  32.35 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  28.45 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  26.05 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  26.89 
 
 
126 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  27.87 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  32.1 
 
 
393 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  29.29 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  29.29 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.58 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  30.53 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  30.53 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  35.85 
 
 
200 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  27.96 
 
 
183 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  23.33 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  24.53 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  27.17 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  26.21 
 
 
123 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  26.47 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  32.05 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  30.11 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  35.59 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>