68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_13301 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_13301  integral membrane protein, interacts with FtsH  100 
 
 		 245 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.796409  normal  0.703525 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14681  integral membrane protein, interacts with FtsH  84.9 
 
 		 245 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243833  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14821  integral membrane protein, interacts with FtsH  84.9 
 
 		 245 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90511  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14441  integral membrane protein, interacts with FtsH  84.49 
 
 		 245 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.467413  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1379  integral membrane protein, interacts with FtsH  84.08 
 
 		 245 aa  390  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0850  integral membrane protein, interacts with FtsH  83.67 
 
 		 245 aa  346  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17031  integral membrane protein, interacts with FtsH  83.67 
 
 		 245 aa  346  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1514  hypothetical protein  75.51 
 
 		 243 aa  335  3.9999999999999995e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19531  integral membrane protein, interacts with FtsH  72.76 
 
 		 246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0885  hypothetical protein  75.92 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1820  hypothetical protein  59.26 
 
 		 242 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53657  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0690  integral membrane protein interacts with FtsH  49.8 
 
 		 242 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0671  hypothetical protein  49.8 
 
 		 242 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2121  hypothetical protein  50.2 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.899925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2056  hypothetical protein  51.01 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.703737 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  31.63 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  32.16 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  30.9 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  27.39 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  25.79 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  28.64 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  25.94 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  26.67 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  27.63 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  29.89 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0424  protein of unknown function UPF0005  25.97 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  25.51 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  23.83 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  25.23 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  27.18 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  27.16 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  23.36 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  33.33 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  30.41 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  23.98 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  26.27 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  24.31 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  24.15 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  23.53 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  24.23 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  26.07 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  26.94 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  23.04 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  25.43 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  25.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  24.79 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  28.91 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  29.61 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  27.5 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  28.91 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  28.91 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  28 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  24.62 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  26.7 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  22.95 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  26.8 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  27.23 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  26.94 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  26.94 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  24.34 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  25.13 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  28.27 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  28.49 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  26.98 
 
 		 236 aa  42  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  27.23 
 
 		 236 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3648  protein of unknown function UPF0005  27.03 
 
 		 241 aa  42  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000291773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>