69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3216 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  50.64 
 
 
319 aa  288  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  43.41 
 
 
308 aa  215  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  40.89 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  37.92 
 
 
274 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  36.96 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  30.77 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  30.03 
 
 
303 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  32.69 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  29.66 
 
 
286 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  30.06 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  27.72 
 
 
306 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  29.74 
 
 
319 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  31.64 
 
 
299 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  29.04 
 
 
333 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  31.02 
 
 
301 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  28.67 
 
 
309 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  31.41 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  28.79 
 
 
310 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  30.12 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  28.47 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  27.87 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  27.59 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  24.85 
 
 
308 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  27.68 
 
 
342 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  27.68 
 
 
342 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  27.59 
 
 
333 aa  89  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  27.61 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  28.09 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  27.55 
 
 
353 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  27.07 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  27.59 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  25.57 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  27.14 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  25.8 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  26.77 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  26.91 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  26.84 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  25.69 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.44 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.44 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.44 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  26.46 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  26.14 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  27.46 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  27.86 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.15 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  31.19 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  31.4 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  27.76 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  25.47 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  31.46 
 
 
327 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  24.61 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  23.9 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  25.23 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3240  hypothetical protein  24.55 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  22.99 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  25.77 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  21.83 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  23.98 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  31.09 
 
 
277 aa  53.9  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  30 
 
 
267 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3220  hypothetical protein  24.36 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.46717  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  29.58 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  26.77 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  25 
 
 
270 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  26.05 
 
 
255 aa  49.7  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  27.03 
 
 
349 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  26.49 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>