19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2958 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2958  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  224  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0448  hypothetical protein  61.95 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0927  hypothetical protein  56.64 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2965  hypothetical protein  53.04 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0991  hypothetical protein  51.89 
 
 		 141 aa  103  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  44.86 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  44.17 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  38.46 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  33.04 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  35.14 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  33.33 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  39.13 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  33.33 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  32.17 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  33.61 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  37.8 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  26.09 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  29.37 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  38.96 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>