18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2760 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2760  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  827    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  27.03 
 
 
405 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2429  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
463 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  22.86 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  20.53 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  31.02 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.54 
 
 
424 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  21.91 
 
 
432 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
432 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  21.94 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
353 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  28.57 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 
430 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  28.5 
 
 
417 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
388 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>