21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4843 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.94 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  29.71 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.71 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.8 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.72 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  29.41 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  29.41 
 
 
237 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.04 
 
 
118 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  23.98 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.18 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31 
 
 
127 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.79 
 
 
244 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.18 
 
 
260 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.18 
 
 
260 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.27 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.24 
 
 
118 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.72 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  27.08 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  28.89 
 
 
126 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.89 
 
 
126 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>