21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2312 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2312  NusG antitermination factor  100 
 
 
217 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.219075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1663  NusG antitermination factor  38.73 
 
 
219 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  28.14 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  27.16 
 
 
176 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  26.14 
 
 
176 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  28.4 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  28.4 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  28.4 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  28.4 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0389  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 
179 aa  46.6  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  28.4 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2764  transcription antitermination protein  28.74 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  27.16 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  28.12 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  27.78 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  27.16 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  27.16 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3420  transcription antitermination protein  24.86 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  25.93 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  24.34 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  23.86 
 
 
176 aa  42  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>