44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1304 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1304  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  865    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2909  putative phage-related reverse transcriptase/maturase family protein  30.98 
 
 		 424 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106568 
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.53 
 
 		 1031 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2104  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.78 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0282857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.22 
 
 		 731 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1245  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.77 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2333  hypothetical protein  29.47 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.823188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3148  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.85 
 
 		 315 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.444355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1777  prophage PSPPH06, putative reverse transcriptase/maturase  32.74 
 
 		 451 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.242663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  29.5 
 
 		 731 aa  50.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3172  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.48 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2079  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225219  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1321  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4539  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.71 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0626  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.82 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000304657  hitchhiker  0.00000002328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2185  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2067  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121404  normal  0.0104805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1923  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1901  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1714  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.125991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1387  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.017267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0976  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.307448  normal  0.190974 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0812  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.158231  hitchhiker  0.0000219513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0624  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0584  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0142  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2652  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2778  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.15 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3179  hypothetical protein  33.61 
 
 		 589 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1227  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.18 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.01115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1870 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0628  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.89 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  0.0521635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.11 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4019  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.01 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0955  group II intron, maturase  24.02 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0056  reverse transcriptase  27.42 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3099  hypothetical protein  35.24 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2471  group II intron, maturase  24.02 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.546508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0572  hypothetical protein  23.62 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3665  hypothetical protein  29.03 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1635  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.22 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4396  hypothetical protein  30.61 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>