16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_86921 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  100 
 
 
785 aa  1597    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  31.86 
 
 
805 aa  355  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  29.29 
 
 
755 aa  261  3e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  29.68 
 
 
766 aa  259  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  29.46 
 
 
732 aa  257  6e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  28.86 
 
 
551 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  28.24 
 
 
696 aa  220  8.999999999999998e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  25.79 
 
 
736 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  27.92 
 
 
717 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  25.89 
 
 
697 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  23.84 
 
 
841 aa  117  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  21.71 
 
 
676 aa  100  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  21.76 
 
 
835 aa  99.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  23.5 
 
 
1205 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88879  clathrin assembly complex beta adaptin component  20.12 
 
 
817 aa  75.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1312  hypothetical protein  28.05 
 
 
406 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0250798  normal  0.495238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>