16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24489 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_24489  predicted protein  100 
 
 		 357 aa  737    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30347  predicted protein  27.34 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.192095 
 
 
-
 
NC_006686  CND04350  protein transporter, putative  32.79 
 
 		 898 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3137  predicted protein  26.25 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30264  putative golgi membrane protein-sorting protein  32.03 
 
 		 158 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398749  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03594  vacuolar protein sorting-associated protein Vps5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12830)  36.52 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80446  protein involved in Golgi retention and vacuolar sorting  31.71 
 
 		 684 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.914331  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03550  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  40.22 
 
 		 612 aa  59.7  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199341  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93346  predicted protein  28.18 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.274788  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02650  hypothetical protein  31.09 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369261  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10594  sorting nexin Snx3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06880)  31.9 
 
 		 142 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06300  lipid binding protein, putative  35.37 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153716  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03560  hypothetical protein  27.75 
 
 		 638 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10918  sorting nexin Mvp1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17180)  32.71 
 
 		 738 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547553 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03584  Sorting nexin-4 (Autophagy-related protein 24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B797]  30.47 
 
 		 487 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27578  predicted protein  33.77 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.57601  normal  0.151799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>