38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17454 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_17454  predicted protein  100 
 
 
291 aa  590  1e-167  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.408947  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47096  predicted protein  31.46 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37201  predicted protein  36.06 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1836  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4549  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
200 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2433  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
195 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0458  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
198 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.977628  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
198 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
402 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5148  pgam5; phosphoglycerate mutase family member 5  24.88 
 
 
204 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.84 
 
 
169 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
412 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
183 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 
200 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  29.36 
 
 
378 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 
220 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  26.73 
 
 
196 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  26.73 
 
 
196 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  34.83 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.17 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0075  Phosphoglycerate mutase  28.23 
 
 
199 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193041  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 
220 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  38.67 
 
 
169 aa  43.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.26 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
207 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.69 
 
 
166 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>