29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2585 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  249  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  80 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  54.4 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  50.41 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  54.05 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  50.68 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  47.95 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  45 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  47.3 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  36.09 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  45 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  36.84 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  46.58 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  49.32 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  46.58 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  45.95 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  41.25 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  43.75 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  43.75 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  43.75 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  46.38 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  41.25 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  35.2 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  35.2 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  31.94 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  37.31 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  45.9 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  33.33 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>