21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1622 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1622  phage protein DNA packaging protein  100 
 
 		 106 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.248492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  91.51 
 
 		 106 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  59.41 
 
 		 103 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0282  uncharacterized phage protein  54.55 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1365  hypothetical protein  51.49 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1889  uncharacterized phage protein  43.43 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2484  phage protein  40.4 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3984  hypothetical protein  47.96 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2022  phage protein  33.33 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2832  uncharacterized phage protein  32.67 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00342048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3941  phage protein  31.37 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.770401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1627  uncharacterized phage protein  32.67 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1723  phage protein  31 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.010366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0908  phiE125 gp8 hypothetical protein  52.83 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0402  phage protein DNA packaging protein  31.68 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3468  bacteriophage protein  40 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6247  Phage-related protein, DNA packing  27.84 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00560086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1417  phiE125 gp8 hypothetical protein  44 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1980  bacteriophage protein  36.67 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1172  phiE125 gp8 hypothetical protein  42 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.218992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1079  hypothetical protein  40.32 
 
 		 199 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>