20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4734 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4734  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 118 aa  236  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4550  hypothetical protein  31.48 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167859 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1182  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00795875  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1273  transcriptional regulator, TrmB  36.26 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.029654 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  42 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  26.85 
 
 		 106 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 215 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>