23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4253 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  225  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  65 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  71.67 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  63.03 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  65 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  65 
 
 		 120 aa  136  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  61.67 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  64.17 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  58.33 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  56.67 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  46.55 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  38.94 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  38.26 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  33.33 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  29.17 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  28.07 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  28.33 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  33.03 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  26.45 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  32.71 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  27.12 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  36.36 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>