29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3964 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  46.41 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  48.46 
 
 		 338 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  46.71 
 
 		 336 aa  252  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  44.38 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  44.04 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  45.25 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  43.95 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  44.23 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  42.72 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  42.22 
 
 		 338 aa  225  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  44.86 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  41.74 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11420  hypothetical protein  43.34 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  42.95 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  40.81 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  41.36 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  40.98 
 
 		 343 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  40.98 
 
 		 343 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  40.98 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  41.55 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0071  hypothetical protein  21.43 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  30.5 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  24.71 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  27.46 
 
 		 368 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0911  hypothetical protein  24.79 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  25.45 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3925  hypothetical protein  27.05 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3700  hypothetical protein  24.05 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>