26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3624 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3624  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  59.09 
 
 
206 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  56.72 
 
 
205 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  56.22 
 
 
205 aa  227  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  60 
 
 
209 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2572  hypothetical protein  59.5 
 
 
209 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2527  hypothetical protein  59.5 
 
 
209 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  52.53 
 
 
205 aa  222  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  61 
 
 
207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  50.73 
 
 
210 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  55.38 
 
 
201 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  41.95 
 
 
233 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  44.22 
 
 
216 aa  155  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  46.63 
 
 
201 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  38.31 
 
 
248 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  39.42 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  34.78 
 
 
236 aa  124  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  36.45 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  36.82 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  36.23 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  37.22 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  30.82 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  22.6 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.98 
 
 
374 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1183  NADPH-dependent FMN reductase  25.56 
 
 
162 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  26.73 
 
 
204 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>