299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2666 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2666  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
551 aa  1072    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2204  apolipoprotein N-acyltransferase  56.32 
 
 
552 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2703  apolipoprotein N-acyltransferase  44.69 
 
 
536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0493141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2349  apolipoprotein N-acyltransferase  43.12 
 
 
539 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00106954  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1210  apolipoprotein N-acyltransferase  39.76 
 
 
540 aa  297  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  37.8 
 
 
517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  40.71 
 
 
566 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1890  apolipoprotein N-acyltransferase  39.96 
 
 
593 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  38.62 
 
 
883 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  39.51 
 
 
527 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2269  apolipoprotein N-acyltransferase  41.06 
 
 
559 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937964  normal  0.125706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2388  apolipoprotein N-acyltransferase  41.27 
 
 
543 aa  266  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733975  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2272  apolipoprotein N-acyltransferase  39.96 
 
 
547 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000100111  hitchhiker  0.0030022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1533  apolipoprotein N-acyltransferase  37.79 
 
 
581 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  38.04 
 
 
541 aa  258  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2933  apolipoprotein N-acyltransferase  41.16 
 
 
583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000865373  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2629  apolipoprotein N-acyltransferase  41.99 
 
 
515 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17898  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4561  apolipoprotein N-acyltransferase  38.92 
 
 
559 aa  250  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14080  apolipoprotein N-acyltransferase  37.97 
 
 
533 aa  249  8e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225972  normal  0.302193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1874  apolipoprotein N-acyltransferase  37.5 
 
 
552 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5817  Apolipoprotein N-acyltransferase-like protein  37.4 
 
 
547 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272998  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3117  apolipoprotein N-acyltransferase  38.26 
 
 
560 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0355571  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3946  apolipoprotein N-acyltransferase  35.08 
 
 
606 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3419  apolipoprotein N-acyltransferase  35.79 
 
 
551 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18480  apolipoprotein N-acyltransferase  37.96 
 
 
524 aa  237  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  34.1 
 
 
551 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2502  apolipoprotein N-acyltransferase  39.95 
 
 
573 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.765014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2547  apolipoprotein N-acyltransferase  39.95 
 
 
573 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464192  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2539  apolipoprotein N-acyltransferase  39.49 
 
 
573 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524723  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1294  apolipoprotein N-acyltransferase  36.08 
 
 
518 aa  226  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.93193  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2199  apolipoprotein N-acyltransferase  36.79 
 
 
522 aa  223  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4508  apolipoprotein N-acyltransferase  38.89 
 
 
568 aa  220  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4185  apolipoprotein N-acyltransferase  35.12 
 
 
518 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2863  apolipoprotein N-acyltransferase  34.72 
 
 
535 aa  216  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  37.7 
 
 
874 aa  216  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2064  apolipoprotein N-acyltransferase  36.27 
 
 
508 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0246959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15980  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
546 aa  205  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1775  apolipoprotein N-acyltransferase  39.58 
 
 
606 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.629044  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25890  apolipoprotein N-acyltransferase  34.9 
 
 
528 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
521 aa  141  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  28.09 
 
 
512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  27.9 
 
 
512 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  27.9 
 
 
512 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 
509 aa  133  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  28.09 
 
 
512 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.9 
 
 
512 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  27.7 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  27.7 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  26.55 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  26.94 
 
 
529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  30.35 
 
 
500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  29.52 
 
 
504 aa  128  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  27.11 
 
 
506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 
505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  26.94 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  26.74 
 
 
529 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  25.81 
 
 
506 aa  127  5e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  26.74 
 
 
529 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 
489 aa  127  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  27.31 
 
 
512 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  27.95 
 
 
515 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  27.95 
 
 
515 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  27.95 
 
 
515 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  27.31 
 
 
508 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  29.82 
 
 
505 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  26.77 
 
 
506 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  30.21 
 
 
505 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  31.61 
 
 
507 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 
507 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  25.3 
 
 
512 aa  123  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 
479 aa  123  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  26.22 
 
 
509 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
497 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  24.43 
 
 
485 aa  120  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  25.6 
 
 
521 aa  120  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  24.3 
 
 
501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  25.29 
 
 
504 aa  118  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  28.49 
 
 
507 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0678  apolipoprotein N-acyltransferase  24.17 
 
 
485 aa  117  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  30.88 
 
 
523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.34 
 
 
524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  27.6 
 
 
532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  25.25 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  25.73 
 
 
537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.13 
 
 
524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  26.85 
 
 
509 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  27.88 
 
 
522 aa  114  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  25.65 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  32.4 
 
 
505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  25.89 
 
 
515 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  30.85 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  25.83 
 
 
514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  29.43 
 
 
510 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  29.52 
 
 
510 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.23 
 
 
503 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 
503 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  26.29 
 
 
511 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  24.19 
 
 
519 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  24.85 
 
 
516 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>