18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1949 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1949  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  590  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25521  hypothetical protein  34.95 
 
 
283 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0205  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0174  hypothetical protein  37.71 
 
 
276 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0591862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  32.93 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  28.97 
 
 
292 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  28.12 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2764  hypothetical protein  23.64 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3873  hypothetical protein  31.44 
 
 
194 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.950409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  26.28 
 
 
285 aa  52.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4078  hypothetical protein  39.06 
 
 
124 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0379122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  23.11 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  18.18 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0282  hypothetical protein  26.85 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  25.2 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  52.94 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  20.71 
 
 
464 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  20.71 
 
 
464 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>