21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1265 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  60.34 
 
 
300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  53.68 
 
 
296 aa  300  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  53.04 
 
 
328 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  53.19 
 
 
336 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  51.59 
 
 
303 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  48.82 
 
 
319 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  42.49 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  40.98 
 
 
283 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  42.63 
 
 
283 aa  188  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  41.11 
 
 
285 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  41.11 
 
 
285 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  34.63 
 
 
295 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  38.78 
 
 
299 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  35.61 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  28.24 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  30.74 
 
 
314 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  26.94 
 
 
280 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  30.4 
 
 
444 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 
453 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  27.83 
 
 
217 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>