164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2507 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  100 
 
 		 478 aa  1003    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  46.04 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  45.53 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  46.92 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  46.48 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  38.43 
 
 		 475 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  38.39 
 
 		 470 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  36.51 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  38.21 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  37.37 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  37.45 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  37.23 
 
 		 471 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  37.12 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  37.12 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  36.93 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  36.93 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  36.72 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  36.72 
 
 		 472 aa  290  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  36.72 
 
 		 472 aa  290  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  35.08 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  33.54 
 
 		 459 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  36.4 
 
 		 466 aa  283  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  35.86 
 
 		 495 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  34.3 
 
 		 511 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  33.54 
 
 		 513 aa  266  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  33.82 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  33.33 
 
 		 519 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  33.82 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  33.61 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  33.61 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  35.04 
 
 		 502 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  35.04 
 
 		 502 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  32.99 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  32.78 
 
 		 520 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  33.54 
 
 		 521 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  33.54 
 
 		 523 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 510 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  35.22 
 
 		 538 aa  259  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  32.92 
 
 		 511 aa  259  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 517 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  35.07 
 
 		 509 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 517 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  33.13 
 
 		 511 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 511 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  33.13 
 
 		 511 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  34.45 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  32.5 
 
 		 511 aa  256  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  33.47 
 
 		 532 aa  256  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  32.98 
 
 		 522 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  32.93 
 
 		 511 aa  256  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  32.93 
 
 		 516 aa  256  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  32.98 
 
 		 522 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  33.55 
 
 		 519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  32.98 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  33.6 
 
 		 517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3906  SpoVR family protein  34.14 
 
 		 512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  34.24 
 
 		 499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  33.2 
 
 		 522 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  34.03 
 
 		 499 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  37.01 
 
 		 416 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  33.12 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  33.83 
 
 		 521 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  32.55 
 
 		 505 aa  249  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  33.07 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1744  SpoVR family protein  32.7 
 
 		 513 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  32.34 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  33.12 
 
 		 560 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 559 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 559 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 559 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  33.12 
 
 		 560 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  33.12 
 
 		 560 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  33.12 
 
 		 560 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  33.12 
 
 		 560 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  33.12 
 
 		 560 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  33.61 
 
 		 559 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  31.13 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  32.44 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  32.98 
 
 		 559 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  32.99 
 
 		 519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  31.71 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  33.54 
 
 		 542 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  32.24 
 
 		 507 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  32.49 
 
 		 560 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2007  SpoVR family protein  32.99 
 
 		 552 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  32.98 
 
 		 516 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  31.62 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>