More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2387 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2387  BolA-like protein  100 
 
 
93 aa  191  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  54.65 
 
 
107 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1443  BolA-like protein  57.61 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2339  BolA/YrbA family protein  57.61 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1934  BolA-like protein  57.61 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2300  BolA/YrbA family protein  57.61 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1207  BolA-like protein  57.61 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  57.33 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3371  BolA-like protein  57.61 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  54.44 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1829  BolA family protein  53.41 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367747  normal  0.761747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  54.55 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  52.27 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1899  BolA family protein  52.27 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  48.84 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  47.5 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2279  putative stress-induced morphogene BolA- like protein  53.26 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1024  BolA family protein  54.26 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.654546  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  46.34 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  47.06 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  52.78 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1921  BolA family protein  52.17 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066107  normal  0.787426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  46.25 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  44.58 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  49.38 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  48.78 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  46.51 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  43.9 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  47.06 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  47.06 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  43.68 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1934  BolA family protein  50 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139583  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6168  BolA-like protein  50 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1911  BolA family protein  50 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  44.71 
 
 
99 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  43.21 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  43.37 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  44.74 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  43.9 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  45.12 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  40.24 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  43.59 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  42.17 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  42.17 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  38.75 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  38.75 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  49.43 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  38.75 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  38.75 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  38.75 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  38.75 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  38.75 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  38.75 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  38.75 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  46.34 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  41.11 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  39.51 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  40.96 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  43.59 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  44.16 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  39.13 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  38.14 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  36.25 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  41.46 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1745  hypothetical protein  53.66 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485281  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  45.21 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  45.21 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  43.42 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  37.5 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  40.24 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  35 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  35 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  56 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  32.99 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  35 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  35 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  38.27 
 
 
85 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  35 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  34.83 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  35.16 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  35.8 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  36.67 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  45.33 
 
 
114 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1531  putative stress-induced morphogen BolA  46.67 
 
 
87 aa  60.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0302247 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  32.22 
 
 
118 aa  60.5  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  41.25 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1867  transcriptional regulator BolA  53.09 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.991732  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  38.75 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  36.36 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  37.5 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  44 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1500  BolA family protein  51.22 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.029191  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  35.96 
 
 
78 aa  58.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  37.5 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  45.95 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  35 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  39.51 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  35 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>