More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2095 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  51.91 
 
 
680 aa  705    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  53.51 
 
 
678 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  61.93 
 
 
685 aa  884    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  63.49 
 
 
682 aa  915    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  51.75 
 
 
687 aa  697    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  55.38 
 
 
678 aa  740    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  100 
 
 
714 aa  1477    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  51.61 
 
 
738 aa  704    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  60.65 
 
 
692 aa  867    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  52.14 
 
 
690 aa  681    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  60.09 
 
 
686 aa  865    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.1 
 
 
682 aa  668    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  54.34 
 
 
679 aa  709    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  61.14 
 
 
802 aa  871    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  53.77 
 
 
679 aa  721    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  51.47 
 
 
680 aa  704    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  52.44 
 
 
680 aa  706    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  62.26 
 
 
716 aa  896    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  58.55 
 
 
704 aa  824    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  58.75 
 
 
691 aa  833    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  51.47 
 
 
680 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  54.22 
 
 
681 aa  687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  51.99 
 
 
690 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  52.62 
 
 
686 aa  667    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  70.19 
 
 
689 aa  1031    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  54.49 
 
 
679 aa  683    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  52.2 
 
 
690 aa  685    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  52.13 
 
 
681 aa  691    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  52.64 
 
 
684 aa  690    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  51.47 
 
 
680 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  51.76 
 
 
680 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  52.88 
 
 
699 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  54.22 
 
 
683 aa  719    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  47.47 
 
 
645 aa  630  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  46.43 
 
 
642 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  44.41 
 
 
652 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  41.5 
 
 
635 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  42.75 
 
 
647 aa  534  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  41.29 
 
 
635 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  41.79 
 
 
647 aa  518  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  42.49 
 
 
676 aa  499  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  43.52 
 
 
644 aa  498  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  55.97 
 
 
846 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  31.47 
 
 
650 aa  290  8e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  30.54 
 
 
600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  28.95 
 
 
587 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.88 
 
 
573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  28.12 
 
 
576 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  28.12 
 
 
576 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  25.4 
 
 
583 aa  158  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  24.82 
 
 
574 aa  157  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  26.02 
 
 
554 aa  142  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.08 
 
 
566 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.9 
 
 
577 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.18 
 
 
566 aa  140  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.57 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  24.69 
 
 
575 aa  133  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.16 
 
 
543 aa  132  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  26.58 
 
 
591 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  25.52 
 
 
543 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  26.44 
 
 
552 aa  129  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  26.56 
 
 
554 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  26.37 
 
 
539 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  25.37 
 
 
611 aa  128  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.39 
 
 
577 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  26.22 
 
 
584 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.21 
 
 
686 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  26.06 
 
 
567 aa  125  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  25.86 
 
 
567 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  25.24 
 
 
538 aa  124  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  24.88 
 
 
542 aa  124  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.88 
 
 
542 aa  124  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  24.1 
 
 
561 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  25.81 
 
 
599 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.64 
 
 
658 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  26.38 
 
 
554 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  23.14 
 
 
546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  24.1 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  26.06 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  26.14 
 
 
571 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  25.39 
 
 
559 aa  122  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  25.17 
 
 
538 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  25 
 
 
700 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.42 
 
 
597 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  23.55 
 
 
561 aa  120  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  25.31 
 
 
564 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  23.71 
 
 
561 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  24.34 
 
 
558 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  22.72 
 
 
561 aa  117  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  25.52 
 
 
556 aa  117  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  26.36 
 
 
549 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  26.36 
 
 
549 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  24.55 
 
 
566 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  23.54 
 
 
561 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  25 
 
 
590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  24.78 
 
 
562 aa  114  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  26.15 
 
 
548 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  23.55 
 
 
688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  25.37 
 
 
577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.17 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>