More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1946 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1946  transposase IS200  100 
 
 
107 aa  222  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  63.55 
 
 
143 aa  149  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  59.81 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  50.47 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  48.6 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  52.48 
 
 
154 aa  113  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  48.6 
 
 
158 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  52.48 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  50.96 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  44.76 
 
 
156 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  46.23 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  45.71 
 
 
156 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  50.5 
 
 
152 aa  107  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  50.5 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  51.49 
 
 
151 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  49.53 
 
 
136 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  44.34 
 
 
160 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  45.79 
 
 
152 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  45.79 
 
 
152 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  45.79 
 
 
152 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  45.79 
 
 
152 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  45.79 
 
 
152 aa  103  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  46.73 
 
 
152 aa  103  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3488  transposase IS200-family protein  44.86 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2995  transposase IS200-family protein  44.86 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1679  transposase IS200-family protein  44.86 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3506  transposase IS200-family protein  44.86 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2533  transposase IS200-family protein  44.86 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0846  transposase IS200-family protein  44.86 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3316  transposase IS200-family protein  44.86 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2202  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.78238 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0847  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.870119  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0809  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0104  IS605 family transposase  44.86 
 
 
152 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.78108e-62  hitchhiker  1.21506e-131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2618  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.361666  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0103  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2751  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000125524  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1279  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000981056  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0333  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  98.6  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000846816  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2455  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2227  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  98.6  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835855  hitchhiker  0.00464434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1439  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.413019  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1602  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1554  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  98.6  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1609  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0741274  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0668  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00213867  normal  0.30365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0253  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000556152  hitchhiker  0.00000156199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2469  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.627217  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2528  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2539  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2559  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000200847  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2283  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2576  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1992  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1978  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0027043  normal  0.681047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0116  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0327  IS1541 transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000467604  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1768  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000130923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1967  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2877  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3127  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.53689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3398  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3869  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000363831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3905  IS1541, transposase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000085189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>