More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2030 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2030  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  295  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4858  integrase catalytic subunit  57.29 
 
 
282 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3307  integrase catalytic subunit  57.29 
 
 
272 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4236  integrase catalytic region  56.25 
 
 
282 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179979  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  56.38 
 
 
251 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  56.38 
 
 
269 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  55.32 
 
 
269 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  55.32 
 
 
178 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  55.32 
 
 
251 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1432  Integrase catalytic region  45.79 
 
 
269 aa  103  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  46.36 
 
 
272 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  46.36 
 
 
272 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  46.36 
 
 
272 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  46.36 
 
 
272 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  46.36 
 
 
272 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  52.63 
 
 
234 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  52.63 
 
 
234 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  52.63 
 
 
305 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  52.63 
 
 
234 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  49.46 
 
 
280 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  52.63 
 
 
305 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  45.79 
 
 
260 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  45.79 
 
 
260 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  45.79 
 
 
274 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1628  ISRSO16-transposase ORFB protein  47.31 
 
 
269 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  48.91 
 
 
281 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  46.67 
 
 
280 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7700  IS3 family transposase  45.95 
 
 
359 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7504  IS3 family transposase  47.47 
 
 
285 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
265 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
265 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
265 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
265 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  40.43 
 
 
280 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  40.86 
 
 
269 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  46.59 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  39.29 
 
 
290 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  39.29 
 
 
290 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0916  IS1404 transposase  41.49 
 
 
277 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.08835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1946  integrase catalytic region  42.86 
 
 
298 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394231  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2268  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2283  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2145  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0640  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
274 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1313  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2797  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1483  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
240 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0188  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0908748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2120  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0978  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.43017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0156  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0152  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
240 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.881638  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0195  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.434557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0291  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0238689  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0377  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0464  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0491  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0629  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000121323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1749  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3409  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  41.49 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>