22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4470 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  614  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  75.68 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  63.58 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  63.55 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  61.9 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  62.24 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  60.34 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  59.39 
 
 		 402 aa  335  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  58.64 
 
 		 327 aa  335  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  57.82 
 
 		 320 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  49.33 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  41.04 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.72 
 
 		 828 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  23.64 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  25.16 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  29.14 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  23.1 
 
 		 918 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  28.08 
 
 		 669 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6776  DNA primase  26.71 
 
 		 671 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  26.71 
 
 		 685 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  26.03 
 
 		 683 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  25.34 
 
 		 634 aa  42.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>